Algunos de los objetivos del Programa son:
* Brindar prácticas bioquímicas y otorgar controles médicos y nutricionales necesarios para el control y seguimiento de la enfermedad.
* Posibilitar la provisión de harinas y pre-mezclas o alimentos aptos, libres de gluten. Para esto se avanza en la firma de acuerdos con los principales supermercados y centros de compra de comestibles de la provincia.
* Organizar un sistema de registro de pacientes con el fin de analizar y ejercer controles, diagnóstico, seguimiento y evaluación.
* Ampliar el Plan de Diagnóstico vigente hasta los 15 años de edad.
* Implementar una chequera de prestaciones médicas.
* Promover y concientizar a la población afectada de la importancia de una dieta adecuada.